《表1 原始数据:油用牡丹PEPC基因的克隆及表达分析》

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《油用牡丹PEPC基因的克隆及表达分析》


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采用RNAprep Pure Plant Kit(Tiangen公司)提取组织材料的总RNA,其中将油用牡丹叶片的总RNA利用M-MLV反转录酶(TaKaRa公司)反转录为cDNA;根据NCBI已登录的植物PEPC基因序列设计1对简并引物RT-F和RT-R(表1),PCR扩增PEPC基因的保守序列,预期1959 bp;扩增体系为20μL,含10×buffer 2.0 mL,每条引物0.5μmol·L-1,dNTP 600·L-1,TaqDNA聚合酶1 U,cDNA模板1000~2000 ng。PCR扩增程序为:95℃变性5 min;95℃50 s,56℃50 s,72℃2 min,35个循环;72℃;延伸10 min。凝胶回收目的片段,连接到pGEM-T easy载体上,转入大肠杆菌感受态细胞DH5α,进行测序。根据得到的保守序列,分别设计1对5′端特异引物和1对3′端特异引物(表1),采用SMARTTMRACE Amplification kit(Clontech)进行扩增,凝胶回收扩增产物,克隆到pGEM-T easy载体上,转入大肠杆菌感受态细胞DH5α,分别进行测序。将保守片段、5′端和3′端序列拼接得到油用牡丹PaPEPC2基因的全长。根据拼接的PaPEPC2基因全长序列,在其编码区设计1对引物ORF-F和ORF-R(表1),进行开放阅读框(ORF)区域的PCR扩增,扩增体系和程序同前,对开放阅读框(ORF)序列进行测序和验证。