《表1 sgRNA oligo序列》

《表1 sgRNA oligo序列》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《利用CRISPR/Cas9系统构建HMGA2敲除肝癌细胞株及其功能鉴定》


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注:下划线为接头序列;斜体为额外添加的G。

根据Gen Bank中发表的HMGA2序列信息(ID:NM_003483),利用CRISPR/Cas9 sgRNA在线设计软件(http://crispor.tefor.net/)分别在HMGA2基因的第一外显子与第二外显子处各设计一条sgRNA,分别命名为sg E1与sg E2(如图1),并在正义链的5'端添加CACC接头,在反义链的5'端添加AAAC接头,便于与酶切载体连接;此外,由于sg E2不是以G开头,所以需在接头与sg E2的5'端之间加上G,以提高U6启动子的转录活性。最终oligo序列如表1所示。