《表2 本试验所用的ARGs引物序列》
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《鳗鲡养殖废弃物抗性基因赋存特征及其与抗生素和微生物群落的相关性》
本研究使用Step O ne Plus?实时荧光定量PC R仪(Thermo fisher scientific,Waltham,MA,USA)对所提取得DNA样品进行ARGs qPCR定量检测,检测的ARGs种类为磺胺类抗性基因(sul1、sul2)、四环素类抗性基因(tetA、tetC、tetG、tetS、tetQ、tetPA、tetPB)以及多重抗性基因emeA,引物的详细信息见表2.qPCR反应体系的总体积为10μL,包括TB Green Premix Ex Taq II(Tli RNaseH Plus)(2×)(Takara,Dalian,China)5μL,Primer F 0.4μL,Primer R0.4μL,ROX参比染料(50×)0.2μL,DNA样品20 ng,ddH2O3μL.qPCR反应程序为:94℃预变性30 s;94℃反应5 s,60℃反应30 s,40个循环;循环结束后72℃延伸5 min.本研究选取16S rRNA为参比基因,采用相对定量的方法,通过计算目的抗性基因与管家基因的表达量比值,计算ARGs的相对丰度[19].
图表编号 | XD00200348900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.25 |
作者 | 黄薇、刘兰英、刘洋、罗土炎、宋永康 |
绘制单位 | 福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所、福建省农产品质量安全重点实验室、福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所、福建省农产品质量安全重点实验室、福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所、福建省农产品质量安全重点实验室、福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所、福建省农产品质量安全重点实验室、福建省农业科学院农业质量标准与检测技术研究所、福建省农产品质量安全重点实验室 |
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