《表2 酸菜发酵过程中原核微生物群落序列数量和多样性参数》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《酸菜发酵过程中理化因子及原核微生物群落结构差异分析》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

注:表中数值为2个同一天发酵样本的平均值

利用Illumina Miseq高通量测序技术可得到679 020条优质序列，平均42 581～53 062条/样本。根据样本的最低序列数对所有样本进行抽平，抽平后进行后续分析。通过OTU聚类（97%相似度）后可得到105个OTU，OTU平均65～95个/样本。每个样本的测序覆盖率>97%，说明测序数目足够，测序序列可以代表其菌群组成。Shannon指数、Simpson指数、Richness指数和Pielou指数是评价群落多样性、丰富度和均匀度的常用指数。由表2可知，发酵1 d时，样本中细菌的Shannon指数、Simpson指数和Pielou指数均最高，说明在发酵初始时群落的多样性和均匀度最高。结果说明酸菜、发酵器具及发酵环境中含有大量的细菌，可能正是这些细菌促进了酸菜发酵。随着发酵的不断进行，Shannon指数、Simpson指数和Pielou指数均逐渐下降。说明酸性环境会抑制大部分微生物的生长繁殖，但会促进某些耐酸微生物的增殖，增加其在群落中的比例，从而造成微生物多样性和均匀度均下降。而Richness指数在整个发酵过程中呈先下降后上升的趋势，说明有些微生物只能在特定的环境下才能激活其生长繁殖，而在其他环境下可处于休眠的状态。