《表3 微生物序列对比情况表》

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《南美白对虾感染真菌毒素后的微生物菌相变化》


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对分离纯化后得到的7株菌通过单菌落法,使用PCR仪扩增得到DNA,将得到的样品送到上海生工,进行16S r DNA测序鉴定。将得到样品菌种DNA序列在EZBILCLOUD上进行序列匹配,每株样品菌种得到1~2株匹配率在97%以上为有效、可信菌株序列(见表3)。通过MEGA 6.0的Neighbor Joining法建立系统发育树,由图3可知,S1与考克氏菌属(Kocuria sp.)同属一个分支,亲缘性较近,鉴定为考克氏菌属,S2鉴定为金黄杆菌属(Chryseobacterium sp.),S3为希瓦氏菌属(Shewanella sp.),S4为弯曲芽孢杆菌属(Bacillus flexus sp.),S5为假单胞菌属(Pseudomonas sp.),S6为细杆菌属(Microbacterium sp.),S7为微小杆菌(Exiguobacterium sp.)。