《表1 cPEPCK抑制剂的抑制活性及分子对接评分》

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《黄嘌呤型cPEPCK抑制剂的计算模型建立》


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*为测试集.

本文选取的28个结构相似的黄嘌呤衍生物在文献[7,18]获得(见图2),它们具有一定的生物活性梯度,适合用于分子对接和3D-QSAR分析.本文使用SYBYL X 2.0软件包中Surflex-dock模块和Topomer CoMFA模块进行研究工作.将活性数据IC50(μmol/L)转化为负对数值(即pIC50),相关数据见表1.以Minimize模块进行分子力学能量优化,优化过程中采用Powell能量梯度法,所用力场为Tripos力场,加载Gasteiger-Hückel电荷,并将最大迭代系数设为1 000.其他参数均采用默认值,优化得到化合物的低能构象.所有操作均在Dell 7500工作站上完成.