《表5 核桃活性成分与靶点蛋白分子对接评分》
蛋白互作网络(PPI)中评分较高的蛋白可以认为起到重要作用,将评分较高的潜在蛋白相对应的靶点与KEGG通路分析结果进行比较分析,将核桃改善记忆的潜在靶点PRKCA(蛋白激酶Cα型)、PRKCB(蛋白激酶Cβ型)作为分子对接的对象。导入PDB数据库,得到PRKCA、PRKCB分辨率较高的蛋白结构3iw4、2i0e。在“活性成分–记忆靶点”中选择度值较高的核桃活性成分:鞣花酸、没食子酰葡萄糖、胡桃醌作为对接分子,在CB-Dock在线平台进行对接,以Vina score得分来评价对接结果(见表5)。Vina是以相应的口袋参数对受体和配体进行分子对接所得到复合物的得分,这个值越低代表受体和配体亲和力越高,对接结果越好。结果发现筛选得到的活性成分与预测的靶点均有结合,其中鞣花酸(ellagic acid)、没食子酰葡萄糖(Pentagalloylglucose)均与PRKCA、PRKCB靶点有较强的亲和力(见图3)。
图表编号 | XD00196077200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.11.21 |
作者 | 吕泓霖、许成梅、陈丹、马雅鸽、陈朝银、赵声兰 |
绘制单位 | 云南中医药大学、云南中医药大学、云南省烟草监测站、云南中医药大学、云南经济管理学院、云南中医药大学 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |