《表3 化香树果序挥发油中活性成分与其关键靶点的分子对接得分值》
分子对接是评价药物活性成分与作用靶点结合能力的一种方法。在网络药理学研究中,分子对接常用来研究活性小分子与网络关键靶点的交互作用,从活性成分与靶点交互作用角度验证交互作用网络的关键靶点[19-20]。通过GO基因功能注释分析和KEGG通路富集分析,得到化香树果序挥发油活性成分作用的参与相关生物过程及信号通路的关键靶点,将关键靶点MAPT,CA9,CA13,CA7,CA5A,CA5B,CA4,CA3,CA2,CA1以及PPARA,PPARD,PPARG,FABP3,FABP4,FABP1,FABP2,FABP7,FABP5,NR1H3,FABP6与相应的活性成分进行分子对接,得出对接打分(total score)。根据分值大小判断小分子配体与靶标蛋白的结合活性,分值越大说明配体与受体结合越稳定,一般分值在6以上说明配体分子与靶点有较好的结合活性[21-22]。如表3所示,大多数活性成分与其核心靶标蛋白有着较好的结合活性。其中(Z,Z,Z)-9,12,15-三烯十八烷酸与其8个核心靶点均有着强烈的结合活性,total score均在7.00分以上,与PPARG的结合能力最好,活性最强,total score为11.090 9分。对接结果与前述核心靶点预测结果基本一致,说明通过网络药理学预测到的结果准确性较好。
图表编号 | XD00181780700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.05.30 |
作者 | 刘本涛、袁彩英、陈睿、黄嘉咏、严振硕、霍丽妮、梁燕 |
绘制单位 | 广西中医药大学药学院、广西中医药大学药学院、广西中医药大学药学院、广西中医药大学赛恩斯新医药学院、广西中医药大学药学院、广西中医药大学药学院、广西中医药大学药学院、广西医科大学药学院 |
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