《表2 对接模式分析:基于分子对接及酶抑制作用预测羟基芫花素肝毒性风险》
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《基于分子对接及酶抑制作用预测羟基芫花素肝毒性风险》
在确定羟基芫花素对接区域后,采用Discovery Studio 2.5中CDOCKER打分功能,对其与靶标蛋白UGT1A1的结合位点进行结合自由能(IE/kcal·mol-1)分析,IE值绝对值越大,代表体系能量越稳定,结合能力更强。由结果可知,芫花素与UGT1A1的IE值为27.780 1 kcal·mol-1,证明其与酶的结合能力较弱。此外,通过对接作用模式结果分析可以看出,羟基芫花素与UGT1A1酶中氨基酸残基GLY332,LYS346主要形成氢键作用;同时羟基芫花素母核的共轭π键与氨基酸残基PHE283,ILE343,VAL345,ILE343形成了疏水结合作用,由于起主导作用的疏水结合仅有一个较为紧密的π-πT-shaped结合,因此缺少足够的疏水结合可能是羟基芫花素与UGT1A1酶亲和能力差的原因。同时,前期实验[13]表明胆红素结合活性区为F区,因此提示羟基芫花素对于UGT1A1酶结合底物胆红素影响较小,见表2。
图表编号 | XD0099623700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.09.30 |
作者 | 汪祺、王亚丹、杨建波、刘越、文海若、马双成 |
绘制单位 | 中国食品药品检定研究院、中国食品药品检定研究院、中国食品药品检定研究院、中国食品药品检定研究院、中国食品药品检定研究院、中国食品药品检定研究院 |
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