《表1 MBDs蛋白的氨基酸组成及其理化性质》

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《DNA甲基化结合蛋白MBD家族的生物信息学分析》


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从MGI、UNIPROT、NCBI三大数据库中搜索MBD基因家族成员,以人(Homo sapiens)的MBD1(Q9UIS9.2)和小鼠(Mus musculus)的MBD1 (Q9Z2E2.2)的氨基酸序列作为标准探针序列,同时建立本地BLAST文库进行数据搜索作为补充数据,搜索得到6个含有MBD结构域蛋白,为了更加明确搜索获得候选基因是否含有冗余蛋白序列,利用SMART和CD search在线工具分析鉴定候选蛋白的MBD结构域,最终获得6条含有典型MBD结构域的非冗余蛋白序列,分别为MBD1、MBD2、MBD3、MBD4、MBD5和MBD6 (表1)。