《表1 不同植物中MDHAR氨基酸组成成分及理化性质分析》
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《茶树CsMDHAR基因的克隆与非生物胁迫响应分析》
运用ExPASy-ProtParam[21]在线工具包对茶树、拟南芥、葡萄等16个物种MDHAR蛋白的组成成分和理化性质进行分析。结果如表1所示,上述物种的MDHAR蛋白氨基酸残基数为433或434,相对分子量在46.49~47.31 kDa。理论等电点为5.5~6.9。脂肪族氨基酸(23%)明显高于芳香族氨基酸(10%),酸性氨基酸占比为13%,碱性氨基酸占比为12%。总平均疏水性(Grand average of hydropathicity)均为负值,表明MDHAR蛋白属于亲水性蛋白。利用NetPhos在线软件对CsMDHAR蛋白的磷酸化位点预测,结果显示,CsMDHAR含有12个苏氨酸(T)磷酸化位点,11个丝氨酸(S)磷酸化位点,9个酪氨酸(Y)磷酸化位点。运用FoldIndex对茶树CsMDHAR蛋白氨基酸序列进行折叠的无序化分析,结果表明CsMDHAR中共有2个无序化区域,无序化比例为4.38%;总体而言CsMDHAR无序化不明显(图4)。
图表编号 | XD0085238500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.10.15 |
作者 | 林士佳、李辉、刘昊、滕瑞敏、刘婧愉、王爽、庄静 |
绘制单位 | 南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所、南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所、南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所、南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所、南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所、南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所、南京农业大学园艺学院茶叶科学研究所 |
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