《表4 设计的引物和Taq Man探针在不同退火温度下对不同瘰螈物种及饲料物种的特异扩增测试》
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《香港瘰螈eDNA引物和TaqMan探针的设计与确认》
—.Ct值>40,为阴性结果。—.Ct value>40 as negative result.
尽管设计的引物和探针在序列分析上有着特异性,但在q PCR反应中使用正确的退火温度才是至关重要,因为如果退火温度太低,容易产生非特异性扩增,而温度太高,则可能影响反应的效率,导致不能扩增或非常高的Ct值、非常低的扩增率(Merck 2019,PCR技术指南)。因此,测试q PCR退火温度是验证引物和探针特异性的关键。通过退火温度的梯度测试(表4),只有在63℃的情况下,引物和探针可以特异性扩增所有12个香港瘰螈的DNA,而其他10个近缘瘰螈物种的11个DNA样本和饲料物种的DNA样本都不能扩增。说明本研究的香港瘰螈特异性引物和Taq Man探针最佳退火温度为63℃。
图表编号 | XD00182640800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.20 |
作者 | 杨泰昌、李嘉华、张颖、刘彦芹、袁智勇 |
绘制单位 | 香港海洋公园环境实验室、香港海洋公园环境实验室、香港海洋公园环境实验室、香港浸会大学生物系、西南林业大学生物多样性保护学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |