《表3 香港瘰螈特异性引物和Taq Man探针在NCBI网站上的比对结果》
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《香港瘰螈eDNA引物和TaqMan探针的设计与确认》
23个瘰螈属样本的Cyt b基因全部成功扩增及测序,全部序列已上传到NCBI Gen Bank基因数据库(表1)。基于这些序列,采用生物信息软件Primer Express Software 3.0比对及计算后,设计出的香港瘰螈特异性引物和Taq Man探针与其他10种瘰螈11个Cyt b基因序列均有变异位点,只会与本研究中12个香港瘰螈的Cyt b基因序列完全匹配,扩增出长度为94 bp的PCR产物并释放荧光信号(表2和图1)。此外,将引物及探针序列在NCBI网站上进行比对分析,仅与香港瘰螈有100%的同源性及100%的序列覆盖率(表3),进一步确认所设计的引物和探针并不会产生非目标物种的扩增。
图表编号 | XD00182640300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.20 |
作者 | 杨泰昌、李嘉华、张颖、刘彦芹、袁智勇 |
绘制单位 | 香港海洋公园环境实验室、香港海洋公园环境实验室、香港海洋公园环境实验室、香港浸会大学生物系、西南林业大学生物多样性保护学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |