《表1 不同Mn2+浓度的易错PCR反应体系的阳性转化率和氨基酸的突变个数》

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《基于易错PCR的β-甘露聚糖酶体外分子定向进化研究》


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在易错PCR反应体系中,调整d NTP的比例,使d CTP、d TTP的浓度增大到1 mmol/L,以促进碱基错配的倾向性.此外,在易错PCR反应体系中分别加入浓度梯度为0 mmol/L,0.01 mmol/L,0.05 mmol/L,0.10 mmol/L,0.15 mmol/L,0.20 mmol/L的Mn Cl2,以得到不同突变频率的文库.用不同Mn2+浓度的易错PCR扩增产物构建表达载体,分别转化大肠杆菌DH5α感受态细胞,从突变文库中的每个Mn2+浓度中随机挑取10—20个克隆子进行菌落PCR,检测其阳性转化率;再从中各挑选3个阳性克隆子进行测序.在易错PCR突变文库的建立中,要考虑的重要因素是突变频率的控制,一般来说,突变基因控制在1—5个碱基,对应的氨基酸突变数为1.0~2.0个比较合理.不同Mn2+浓度的易错PCR反应体系的阳性转化率和氨基酸的突变个数如表1所示.由表1可知,当添加Mn2+的浓度为0.01 mmol/L时,阳性转化率最高,达到80.0%,且氨基酸的突变个数为2.0个,符合易错PCR突变文库的一般构建原则.