《表1 芦笋胆固醇生物合成酶及其编码基因》
催化反应中以C开头的字符串是KEGG中化合物的结构编号。
众所周知,胆固醇是植物多种甾体皂苷生物碱、甾体皂苷元及其糖基修饰物的重要合成中间物质。虽然在动物和真菌中胆固醇的合成途径早已阐明(Rozman等1996;Holstein等1966;Cerqueira等2016),但直到2016年Sonawane等(2016)整合了番茄基因组、转录组和蛋白组等表达数据,推定与胆固醇生物合成相关的候选基因,并经基因沉默、体外合成酶活性检测和酵母突变体互补方法才首次阐明了植物胆固醇合成途径。以KEGG(https://www.genome.jp/kegg)等数据库中甾体皂苷合成通路为依据,结合芦笋基因组注释信息,以乙酰辅酶A或甘油醛-3-磷酸与丙酮酸为合成前体,将番茄胆固醇合成相关酶的蛋白序列与芦笋蛋白组进行BlastP比对,筛选相似度大于40%、覆盖度大于80%、Evalue小于1×10-6的目标序列后,通过去冗余等筛选到参与5碳活性中间原料(IPP和DMAPP)的合成相关酶,同时预测了芦笋中FDPS、SS、SE、CAS和SSR2等合成芦笋皂苷基本碳骨架—胆固醇(cholesterol)代谢途径相关合成酶(图2和表1)。
图表编号 | XD00181513100 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2020.07.20 |
作者 | 皇秋秋、杜加欢、尹俊玉、刘正杰、林春、毛自朝 |
绘制单位 | 云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学农学与生物技术学院、北京农林科学院玉米研究中心、云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学小宗作物研究中心、云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学小宗作物研究中心、云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学小宗作物研究中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |