《表3 梨LG3候选区域SSR标记筛选》
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《基于基因组重测序数据高效筛选梨SSR标记多态性引物》
注:第4、5、6列表示重复序列两端11 bp序列之间的长度;0表示重测序数据中未能检测到条带。Note:Column 4,5 and 6 represent the sequence length between two flanking regions of 11 bp;Zero represents no bands detected in re-sequencing data.
为了验证本研究中的方法,对梨3号染色体Chr3:4 990 350~22 321 205 bp区域内的SSR引物在‘早生新水’和‘秋水’中的多态性进行筛选。从446对已开发SSR引物中共获得13对多态性好的引物(表S1),由于标记密度太低,对这一区域新开发了16对引物。根据重测序预筛结果,从29对引物中共筛选出10对多态性好的引物用于进一步验证(表3)。
图表编号 | XD0032058200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.10 |
作者 | 蒋爽、骆军、王晓庆、施春晖 |
绘制单位 | 上海农业科学院林木果树研究所·上海市园艺重点实验室、上海农业科学院林木果树研究所·上海市园艺重点实验室、上海农业科学院林木果树研究所·上海市园艺重点实验室、上海农业科学院林木果树研究所·上海市园艺重点实验室 |
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