《表3 SSR分子标记统计》

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《薏苡苗期叶片全长转录组测序、注释及SSR预测》

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SSR（Simple sequence repeats）是一类广泛存在于真核生物基因组中，由1～6个核苷酸为重复单位组成的长达几十个核苷酸的重复序列，广泛应用于遗传图谱构建、遗传多样性分析、亲缘关系分析以及种质鉴定等（Gulcher，2012）。利用MISA程序对98 858条Unigenes序列进行SSR位点搜索分析，结果表明：在38 878个Unigenes（占39.33%）中存在SSR位点，其中，10 138个Unigenes存在1个以上SSR位点，7 450个Unigenes存在复合型SSR位点（表3）；累计共获得56 540个SSR位点，其中，单碱基、双碱基及三碱基重复的SSR位点占绝对优势，分别占总SSR位点的49.51%、13.49%和34.28%，三者占比达97.28%（表3）。上述结果，为后续薏苡SSR分子标记开发、遗传图谱构建、种质资源鉴定等提供丰富的参考数据。