《表2 Unigene数量最多的30条代谢途径》

《表2 Unigene数量最多的30条代谢途径》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《薏苡苗期叶片全长转录组测序、注释及SSR预测》


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KEGG(Kyoto encyclopedia of genes and genomes)是一个整合了基因组信息、生物化学信息及系统功能信息的数据库,广泛应用于高通量测序所获得基因序列的功能注释和系统整合(Kanehisa and Goto,2000)。KEGG注释分析发现:30 579个薏苡Unigenes被成功注释,涵盖了KEGG数据库5个大类(level 1)、19个亚类(level 2)以及133条已知的代谢途径(level 3)(图5)。Unigenes分布最多的前30个代谢通路覆盖了KEGG途径能量代谢、碳水化合物代谢、氨基酸代谢、脂质代谢、核酸代谢、次生代谢物合成、转录翻译、蛋白折叠、分选与降解、环境适应及信号转导等13个亚类,共富集了14 201个Unigenes,占注释基因的46.44%(表2)。值得注意的是,植物对干旱等非生物逆境胁迫的响应是一个及其复杂的生物学过程,而渗透调节途径、抗氧化途径,以及激素信号或其他信号转导途径等是植物响应干旱等非生物胁迫的三种主要方式(Wang et al.,2016b;沈少炎等,2017)。薏苡Unigenes富集与抗逆物质合成和转运相关代谢途径,如苯丙素生物合成(ko00940,714)、内质网蛋白加工(ko04141,749)等(表2;图6A;图6B),与抗氧化相关代谢途径,如半胱氨酸和甲流氨酸代谢(ko00270,451)、过氧化物酶体(ko04146,665)等(表2;图6C),以及与激素信号或其他信号转导相关代谢途径,如植物病原互作(ko04626,775)、植物激素信号转导(ko04075,733)等(表2;图6D)可能参与干旱胁迫响应,而代谢通路上相关Unigenes为薏苡抗旱相关基因的筛选、克隆及进一步功能验证提供了丰富的候选基因序列数据。