《表1 本研究所用引物:澳洲宝石鲈热休克蛋白90-β基因(HSP90-β)的cDNA克隆与表达》

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《澳洲宝石鲈热休克蛋白90-β基因(HSP90-β)的cDNA克隆与表达》


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在NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuc-core)中查找鲈形目鱼类HSP90-β的编码序列,并用DNAssist(2.2)进行序列比对。找出保守序列,并参照简并引物替换表设计简并引物,使用高保真酶KOD One PCR Master Mix-Blue(TOYOBO,日本)进行PCR。反应条件为95℃,1 min,1个循环;98℃,10 s,1个循环;(98℃,10 s;55℃,30 s;68℃,5 s),40个循环;68℃,5min,1个循环;4℃,∞。将PCR产物进行琼脂糖凝胶电泳,并将目的条带切胶回收,经测序得到核心片段序列,并参照该序列设计RACE引物。使用Td T转移酶法进行RACE,引物AP用于3'RACE模板的制作,引物AAP用于5'RACE模板的制作。将5'RACE、3'RACE扩增得到的序列与NCBI数据库序列进行比对,确认得到目的序列后,将其与核心片段序列拼接得到完整的c DNA序列,并从该序列上设计引物扩增得到完整的CDS。引物详见表1。