《表4 典型相关系数矩阵:柑橘溃疡病抗性SNP验证及其相关钙依赖性蛋白激酶基因诱导表达》

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《柑橘溃疡病抗性SNP验证及其相关钙依赖性蛋白激酶基因诱导表达》


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根据SNP分型结果对143个供试材料SNP位点的基因型进行赋值,运用DPS软件对供试材料的基因型值和病斑面积及病情指数进行简单相关和典型相关分析。简单相关分析结果表明,多个SNP位点基因型与病斑面积及病情指数相关性显著。而典型相关显著性检验结果显示,供试材料SNP基因型与病斑面积相关系数为0.4849,P=0.0016<0.05,相关性显著(表3);SNP基因型与病情指数相关系数0.3796,P=0.088>0.05,两者不相关。典型相关分析结果显示,与病斑面积相关系数绝对值>0.2的SNP位点5个,分别是HP31、HP42、HP85、HP87、HP170(表4),表明这5个SNP与柑橘溃疡病病斑面积相关性较高,可作为柑橘溃疡病耐性材料筛选的候选SNP标记。其中HP31为Cs CDPK编码区靠近5′UTR端的SNP。