《表4.YC89对供试病原菌抑菌活性分析》
以菌株YC89的DNA为模板扩增16S rDNA基因片段,通过BLAST软件进行同源性比对,并用MEGA7.0软件构建系统发育树。结果显示用细菌通用引物27F/1492R对菌株YC89进行PCR扩增,扩增产物经测序,其目的片段大小为719 bp。将测序结果在NCBI上用BLAST软件进行同源性比对,菌株YC89与贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)以及西姆芽孢杆菌(Bacillus siamensis)的同源性达99%。利用MEGA7.0软件构建系统发育树(图3-A)YC89与贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)、解淀粉芽孢杆菌(Bacillus amyloliquefaciens)以及西姆芽孢杆菌(Bacillus siamensis)同属一分支,其中与Bacillus velezensis strain PG-2-MS(MH838019.1)距离最近。将gyrA基因序列的测序结果在NCBI中进行BLAST比对,结果显示菌株YC89与Bacillus velezensis的gyrA基因序列最为相似,同源性达100%。构建系统发育树(图3-B)菌株YC89与Bacillus velezensis处于同一个分支,其中与Bacillus velezensis strain M75(CP016395.1)距离最近。综合上述结果最终将菌株YC89确定为贝莱斯芽孢杆菌(Bacillus velezensis)。
图表编号 | XD00174035600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.04 |
作者 | 谢林艳、狄义宁、何丽莲、刘鲁峰、沈先岳、李富生 |
绘制单位 | 云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学甘蔗研究所、云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学农学与生物技术学院、云南农业大学甘蔗研究所 |
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