《表1 推荐软件:云环境下“生物信息学”实验教学课程改革探索与实践》

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《云环境下“生物信息学”实验教学课程改革探索与实践》


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目前生物信息学软件不下1000种,而且有很多软件功能类似,这要求实验设计和系统集成密切配合,负责教学的教师积极参与实验设计,过滤、归纳实验教学中用到的软件,并研究设计实验完整流程和步骤。如RNA-seq数据分析,需考虑是否需要进行序列组装,是有指导组装还是独立组装等问题;如何进行序列比对,比对结果数据如何阅读、如何分析;甚至是否需要引进AI技术等等。表1所示,列举部分常用软件: