《表2 3株H6N6病毒的NA、PB2和PB1-F2氨基酸序列》

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《鸡源禽流感病毒H6N6亚型在猪呼吸道组织的复制及其基因特点》

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基因测序结果显示，3株H6N6亚型AIV的HA裂解位点序列均为PQIETG/GL，仅有单个碱性氨基酸。全部毒株的HA蛋白头部的受体结合位点为137C、190E、224N、226Q、228G、318L。ZZ346病毒株HA的158位点发生氨基酸缺失，156位点发生H156R突变，263位点发生S263G突变，而其余两株病毒此位点未发生变化，见表1。神经氨酸酶（neuraminidase，NA）氨基酸序列分析发现，ZZ346病毒株的NA颈部出现11aa的缺失，其位点位于59～69位，其余两株病毒的NA颈部未出现氨基酸缺失，见表2。