《表1 短花药野生稻水通道蛋白基因家族》

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《短花药野生稻(Oryza brachyantha)AQP家族的全基因组序列鉴定及其特征分析》

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从NCBI下载水稻（Oryza sativa）AQP蛋白质序列作为查询对象，进行BLAST和HMMer搜索以鉴定短花药野生稻的AQP，使用Pfam确定结构域，进行筛选，使用ExPASy对蛋白质性质进行预测。在短花药野生稻基因组中鉴定了39个ObAQP基因，预测显示Ob AQP蛋白大多有200～300个氨基酸；ObSIP1-1含有182个氨基酸，较其他AQP较小。预测得到的Ob APQ蛋白的氨基酸残基数为134～293，它们的相对分子量为13.51～31.78 kD，39个ObAPQ基因与33个OsAQP基因的进化树分析表明AQP家族可分为4个亚族，基于它们与的水稻对的进化树关系将其命名为ObPIPs、ObSIPs、ObTIPs、ObNIPs（表1），进化树（图1）显示，ObAQP基因与水稻的AQP基因密切相关，这与当前建立的植物进化关系一致。