《表1 金针菇基因组中34个小G蛋白家族基因》
本研究通过使用已知真菌小G蛋白同源比对,在金针菇单核体菌株L11的基因组11 526个预测基因中鉴定到34个小G蛋白编码基因(表1)。这34个小G蛋白可进一步分为5个家族:7个属于Ras家族;7个属于Rho家族;12个属于Rab家族;7个属于Arf家族;1个属于Ran家族。进一步的结构域分析结果显示,所有小G蛋白含有Ras/Rho/Rab/Ran家族特异性PF00071结构域或Arf特异性结构域PF00025。使用NCBI网站在线BLASTP程序对所有小G蛋白比对分析,均含有G box和Switch I/II结构域。
图表编号 | XD00196575600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.25 |
作者 | 张梦飞、刘芳、王庆佶、严俊杰、王威、钱玉翠、黄清铧 |
绘制单位 | 山东农业大学植物保护学院,山东省农业微生物重点实验室、福建农林大学生命科学学院,福建农林大学菌物研究中心、山东农业大学植物保护学院,山东省农业微生物重点实验室、福建农林大学生命科学学院,福建农林大学菌物研究中心、山东农业大学植物保护学院,山东省农业微生物重点实验室、福建省林业科学研究院、广东省生物工程研究所(广州甘蔗糖业研究所),广东省甘蔗改良与生物炼制重点实验室 |
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