《表1 ABC转运蛋白家族相关基因簇统计》
对转录组中39 183条基因簇以ABC转运蛋白为关键词在NR、GO、KEGG 3个数据库中进行筛选,结果共有337条基因簇被注释,这些基因簇的表达量FPKM值介于0~180.57之间,序列拼接长度介于165~6 827 bp之间。这些被注释的基因簇中,87.83%在3个数据库中均有注释,3.86%只注释到了1个数据库中。有299条被GO数据库注释、321条被KEGG数据库注释、146条被NR数据库注释。GO本体中注释的细胞组分数据库有13个,分子功能数据库有34个,生物过程数据库有68个;NR数据库中注释的ABC转运蛋白家族有8个,包括ABCA、ABCB、ABCC、ABCD、ABCE、ABCF、ABCG和ABCI(表1)。KEGG注释的有28个代谢途径分支,排名前10的为K05658(226个)、K00924(102个)、K12843(81个)、K05681(80个)、K04733(54个)、K05666(40个)、K02065(20个)、K13430(15个)、K05643(13个)、K05663(13个)。
图表编号 | XD0065577200 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2019.08.10 |
作者 | 张小芳、乔亚科、王冰冰、徐燕、张锴、李桂兰 |
绘制单位 | 河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院农学与生物科技学院、河北科技师范学院农学与生物科技学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |