《表2 短花药野生稻AQP基因上游序列预测》

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《短花药野生稻(Oryza brachyantha)AQP家族的全基因组序列鉴定及其特征分析》

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为了明确ObAQP基因结构，根据其基因组信息获取每个ObAQP基因的CDS（Coding DNA sequence）和UTR（Untranslated region）序列并绘制结构图（图2），结果表明同一亚族的基因大多具有通或相似的结构，如ObNIP1-1、ObNIP1-2、ObNIP1-3、ObNIP1-4启始均没有UTR，ObTIP2-1与ObTIP2-2结构相同。此外，使用PlantCARE鉴定预测了ObAQP基因的编码序列2 000 bp上游序列以及应激反应性顺式元件，包括ABA响应元件（ABRE）、脱水响应元件（DRE）、低温响应元件（LTRE）、乙烯响应元件（ERE）、MYB结合位点（MBS）和赤霉素响应元件（GARE）。结果显示，33个ObAQP基因含有ABRE、18个含有DRE、14个含有LTRE、21个含有ERE、全都含有MBS、9个含有GARE（表2）。根据上述结果，所有的ObAQP基因在其启动子区域中含有至少一种相应元件，表明这些基因可能参与对不同非生物应激源的反应，对植物水通道蛋白基因的表达进行调控。