《表2 药用野生稻和其它植物的GBSS氨基酸序列一致度》
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《药用野生稻GBSS基因的系统发育及组织特异性表达》
*从UniProt库获取的氨基酸序列;**括号内的样品号代表包含GBSS基因序列的scaffold的GenBank号。
为深入了解药用野生稻GBSS基因和其它植物在DNA序列水平上的遗传差异并探究该基因在植物中的分子进化趋势,我们利用NCBI(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)和Uniprot(https://www.uniprot.org/)数据库,结合注释查询和以目标基因为搜索项的BLA-ST搜寻(阈值设为1e-5),对具有全基因组数据的18种植物(表2)的GBSS同源基因的核苷酸或其编码的氨基酸序列进行全面查找。将获取的所有序列全部转换成蛋白序列并导入Seaview软件(Gouy et al.,2010)。采用Clustal W方法进行对位排列后,利用PhyML v3.0.1软件(Guindon and Gascuel,2003)在默认模式下构建最大似然性(maximum likelihood,ML)系统发育树。以藻类植物莱茵衣藻(Chlamydomonas reinhardtii P.A.Dang.)作为外类群。
图表编号 | XD0064051100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.05.10 |
作者 | 张霞、景翔、周光才、包颖 |
绘制单位 | 曲阜师范大学生命科学学院、曲阜师范大学生命科学学院、淄博市临淄区第二中学、曲阜师范大学生命科学学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |