《表1 普通野生稻39个线粒体基因的GC含量及Nc值》

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《普通野生稻线粒体蛋白质编码基因密码子使用偏好性的分析》

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研究结果显示，普通野生稻39个线粒体编码基因的总体GC含量为44.24%，而其整个线粒体基因组GC含量为44.04%，两者基本一致。GC含量在密码子3个位置上有差异，GC1、GC2和GC3分别为49.18%、42.67%和40.86%，其分布趋势依次为:GC1>GC2>GC3。这与密码子第1、第2、第3位的简并性趋势相反，第1、第2位受到的选择压力比第3位更大，即在普通野生稻的线粒体基因组中，以G或C碱基结尾的密码子使用频率低于A或T碱基结尾的密码子。Nc的理论取值范围为20～61，其值越小，同义密码子的偏性则越强。普通野生稻线粒体基因组各编码序列的Nc值为45.32～61.00（表1）。包括细胞质雄性不育相关基因CW-orf307在内的所有基因Nc值均大于45，可以判断普通野生稻线粒体基因密码子偏性很弱。其中orf153、orf176、orf152a、rps74个基因的Nc值为61，表明其同义密码子的使用没有偏好性。rps13基因的Nc值最小，其数值为45.32。细胞质雄性不育相关基因CW-orf307的GC1、GC2和GC3值分别为54.22%、44.16%和43.18%，均略大于普通野生稻39个线粒体编码基因的第1、第2、第3位GC含量。