《表2 不同猪种的基因组中ktn1(基因及上游5 kb和下游3 kb侧翼区)序列来源和长度》
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《转座子引起的猪ktn1基因结构变异及其与生产性能的关联分析》
经过与NCBI的WGS数据库中不同品种的猪基因组测序数据比对,获取到14个测序基因组中ktn1(基因及上游5 kb和下游3 kb侧翼区)的序列,ktn1序列的来源及在各基因组中的长度见表2。从不同品种的测序基因组中获取到的ktn1(基因及侧翼区)长度存在一定的差异,八眉猪(Bamei pig)、长白猪(Landrace pig)和大白猪(Large White pig)中获取的序列长度与杜洛克猪(Duroc pig)参考序列长度相近(117 382 bp),在杂交猪(Cross-bred pig)、哥根廷猪(Gottingen pig)、金华猪(Jinhua pig)和荣昌猪(Rongchang pig)中,序列长度略小于参考序列,但在五指山猪(Wuzhishan pig)和巴克夏猪(Berkshire pig)的基因组中获取的序列明显短于参考序列,分别只有115 708 bp和114 968 bp,提示在ktn1基因或其侧翼区中存在结构变异。
图表编号 | XD00138049300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.02.25 |
作者 | 陈才、陈伟、郑尧、顾浩、王伟、王宵燕、高波、宋成义 |
绘制单位 | 扬州大学动物科学与技术学院、扬州大学动物科学与技术学院、扬州大学动物科学与技术学院、扬州大学动物科学与技术学院、扬州大学动物科学与技术学院、扬州大学动物科学与技术学院、扬州大学动物科学与技术学院、扬州大学动物科学与技术学院 |
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