《表3 杜洛克参考基因组中ktn1基因中转座子数量及序列贡献信息》

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《转座子引起的猪ktn1基因结构变异及其与生产性能的关联分析》


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由于杜洛克参考基因组中ktn1基因序列最为完整,因此以杜洛克中ktn1基因的转座子注解信息进行统计分析,在ktn1基因及其侧翼区中鉴定到77个转座子标记位点,其中76个为反转录转座子(98.70%),其中SINE最多,有54个位点,最年轻的家族SINEA有49个位点。对标记长度进行统计分析发现,117 382 bp的ktn1(基因和侧翼)序列中共有26 364 bp(22.46%)被转座子标记,其中最多是SINE(13 638/11.62%),其次是LINE(11 328/9.65%),其中最年轻SINE家族SINEA标记了12 588 bp占10.72%。ktn1基因中转座子数量及序列贡献信息见表3。