《表1 不同鸡种TAP1基因每kb发生SNPs的数量》

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《不同鸡种TAP1基因SNPs和INDEL比对分析》


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注:第2、3列表示TAP1基因全长发生SNPs的数量及比例,第4、5列表示TAP1基因外显子发生SNPs的数量及比例。

与参考序列相比,在29个鸡种中共有270个SNPs,结果见表1。结果显示,TAP1基因共有11个外显子,所有外显子中共有116个SNPs,占SNPs数的42.9%,并且大多数核苷酸多态性发生在内含子上。由表2知,外显子上的SNPs主要发生在外显子9和外显子1上,分别占突变核苷酸的25%和24%,说明外显子9和1在物种进化中更具多态性,外显子6上没有出现突变,说明外显子6区域在进化过程中十分保守。