《表3 不同羽色鸡种ASIP基因各SNP位点等位基因频率估算结果》

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《不同羽色鸡种ASIP基因SNP位点筛选及其生物信息学分析》


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运用MWSnap v3.00.74对各SNP位点的等位基因峰高进行测量,并估算等位基因频率,结果(表3)表明,Exon-2-G17C、Exon-2-C3032T、Exon-2-G3313T和Exon-2-C3350T等SNPs位点等位基因频率在6个鸡种中存在不同程度的差异。其中,Exon-2-T3203G只出现在罗曼蛋鸡上,Exon-2-G3287A只出现在瑶山鸡上。此外,Exon-2-T168C位点在贵州黄鸡和兴义矮脚鸡白羽系的等位基因频率不同,且该SNP位点突变导致编码氨基酸改变[苏氨酸(Thr)→甲硫氨酸(Met)];其他SNP位点突变均未导致编码氨基酸改变。