《表3 TAP1基因中SNPs和插入缺失以及氨基酸变化》

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《不同鸡种TAP1基因SNPs和INDEL比对分析》

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由于TAP1基因存在插入和缺失，不同鸡种TAP1基因长度不同（见表3）。从SNPs和碱基的插入和缺失情况看，TAP1基因发生在外显子上且引起非同义突变的SNPs共有82个，突变最多的是A/G，其中外显子9中引起氨基酸突变的SNPs有22个，占26.8%(22/82），其次是外显子8（引起氨基酸突变的SNPs有15个）和11（引起氨基酸突变的SNPs有10个），分别占18.3%(15/82）、12.2%(10/82），氨基酸同源性高于核苷酸；除外显子11发生碱基缺失以外，其他外显子均未有Indel发生，其中缺失的片段长度在6～16个碱基范围内，这些碱基的缺失最终导致氨基酸序列的缺失。