《表4 全基因组中插入和缺失位点的数量以及其在CDS区发生变异的数量统计》

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《水稻杂种劣势相关亲本的全基因组重测序及其遗传变异分析》

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在全基因组重测序后，我们分别统计了‘Liyu B’、CH7、CH8和CH9基因组中1～10 bp大小的插入片段和缺失片段，并统计了变异位点处于编码序列（coding sequence，CDS）区InDels。结果显示，重测序的4个水稻材料基因组中，片段缺失的发生频率均略高于片段插入发生的频率（表4），对照品种‘Liyu B’基因组中总共检测到了91 182个InDels变异位点，其中2.03%的变异位点发生在了CDS区。CH7、CH8和CH9基因组中分别检测到了86 587个、151 761个和107 347个InDels变异位点，发生在CDS区的变异位点比例分别为2.13%、1.96%和2.01%。