《表2 水稻12条染色体上SNPs和InDels变异位点的数量统计》

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《水稻杂种劣势相关亲本的全基因组重测序及其遗传变异分析》

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对杂种劣势相关的3个亲本品种CH7、CH8和CH9以及对照品种‘Liyu B’全基因组重测序数据比对参考基因组后，对照品种‘Liyu B’总共获得了566 491（475 309个SNPs，42 925个插入片段和48 257个缺失片段），CH7总共获得了574 551（487 964个SNPs，41 870个插入片段和44 717个缺失片段），CH8总共获得了1 026 428（874 667个SNPs，73 562个插入片段和78 199个缺失片段），CH9总共获得了792 465（685 118个SNPs，52 144个插入片段和55 203个缺失片段）。其中，CH8基因组检测得到的变异位点几乎是‘Liyu B’或CH7的2倍（表2）。