《表1 10条玉米染色体的单倍型块数目以及标签SNPs数目》

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《基于SNP标记的玉米自交系类群划分方法和分群功效评估指标的比较》

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该方法是本试验室开发的分群流程。它利用Haploview V4.2软件先对525141个SNP位点进行单倍型块（haplotype block）分析和单倍型提取，在每个单倍型块中寻找标签SNPs[26-28]，即可以代表该单倍型块的行为的SNPs，将标签SNP作为ADMIXTURE软件的输入数据。用Haploview V4.2软件对10条染色体上的SNPs进行单倍型块分析的结果见表1。从3618个单倍型块中挑选出4849个TagSNP位点，将其多态性信息输入ADMIXTURE V1.3.0软件中，该软件根据群体遗传学中的群体混合原理汰选SNP，最终实际使用929个TagSNP位点信息。