《表1 柴达木黄牛不同Y染色体单倍型组类型、频率及单倍型多样度》

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《柴达木黄牛Y-SNPs遗传多样性、群体遗传结构及父系起源》

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注:a:本研究中未发生变异的核苷酸位点，其对应于先前报道中的家牛SNP位点；括号内数字代表不同单倍型组的个体数Note:a showed the nucleotide sites without variation in this study which corresponding to the SNP sites in bovine reported previously；The numbers in brac

通过对62头柴达木黄牛2个Y-SNPs标记（即UT-Y-19和ZFY-10）PCR扩增产物进行纯化测序，后与G觟therstr觟m等（2005）和Ginja等（2009；2010）报道的家牛相应序列（Gen Bank登录号:AY936543和AF241271）进行比对分析，结果表明:2个标记在62头柴达木黄牛中具有多态性，其中UTY-19标记发现存在1个C>A核苷酸颠换（图1），而ZFY-10标记在先前家牛研究报道中存在SNP（C>T）位点的位置在本研究中未检测到SNP，只发现1个GT核苷酸插入/缺失多态位点（图2）。参考G觟therstr觟m等（2005）和Ginja等（2009；2010）对家牛Y染色体单倍型组的判定标准，依据2个标记的核苷酸变异确定单倍型组（表1），结果显示:62头柴达木黄牛被确定为Y1和Y2两种单倍型组，其中13头牛为普通牛Y1单倍型组个体，另49头为Y2单倍型组个体，Y1和Y2单倍型组个体所占频率依次为0.21和0.79，提示柴达木黄牛品种由2种普通牛单倍型组构成，以Y2单倍型组为主，Y1单倍型组为辅。柴达木黄牛品种单倍型多样度为0.336 9±0.060 5，提示其父系遗传多样性较低（表1）。