《表1 猪蛔虫样本的地理来源、ITS1基因的基因型及单倍型》

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《猪蛔虫个体内ITS1序列差异比较》


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扩增ITS1基因获得约500bp的片段(图1),PCR产物经纯化、酶连、转化培养后,通过琼脂糖凝胶电泳检测菌落PCR产物(图2),获得15个克隆子。测序共得到7个不同的ITS1基因序列。通过MEGA5.0将经过分子克隆的测序结果与GenBank中的序列(G1-G6)进行对比,有2个ITS1基因序列与之前研究过的2种基因型(G2和G3)相同,除此之外还检测到5种新的单倍型(命名为HC1-HC5)(表1) 。在所测样本中,有2个样本(ZC2和ZC5)检测到3种基因型或单倍型,有1个样本(ZC1)检测到2种基因型或单倍型,没有样本检测到G1、G4、G5、G6基因型(表2),G3基因型存在大多数的样本中。检测到的新的单倍型和GenBank中已有的基因型或单倍型部分多态位点见表2。