《表3 SESN1基因单倍型及单倍型频率》

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《优质鸡SESN1基因单核苷酸多态性及其与生长性状的关联分析》

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注：单倍型频率<0.001时不被考虑，H：单倍型。

利用Haploview软件基于D′（连锁不平衡参数）分析，发现在优质鸡中SESN1基因CDS区前2 000 bp可划分为C-1365T～G-1543C、G-1177A～C-1294A、T-1058G～T-1076A组成的3个单倍型块。Gabriel等[12]通过研究发现，当单倍型块D′>0.98，即可定义为“强LD”，通过对D′分析，发现3个单倍型块均处于强连锁状态，同时，C-1365T～G-1543C组成的单倍型组为强LD(SNP之间的D′=1），并且每个位点的等位基因不会随机重组（见图1）。各单倍型及单倍型频率见表3。