《表3 ITPR1基因SNP位点的单倍型频率》

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《三穗鸭ITPR1基因SNPs鉴定及其与蛋壳品质性状的关联性》

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利用在线软件SHEsis对三穗鸭ITPR1基因SNP位点进行单倍型和连锁不平衡分析。单倍型分析结果表明，14个SNP位点共发现13种单倍型，其中H2（CAGTGACTGTGGGC）为优势单倍型，频率为0.131；H11（TCAATGCGAC）为劣势单倍型，频率为0.060（表3）。当连锁不平衡系数D'>0.75和r2>0.33时两个位点之间具有强连锁不平衡效应（赵宪林等，2018），连锁不平衡分析结果显示（表4），g.46455T>C、g.46459C>A、g.46564A>G、g.46581A>T和g.46649T>G各位点两两之间，g.46581A>T、g.55537A>G、g.55620G>T、g.55664A>G、g.55680C>T和g.55709T>G各位点两两之间，g.72601T>G与g.72843A>G位点之间，均存在强连锁不平衡效应；其余各突变位点之间的D'和r2值均分别小于0.75和0.33，两两之间不存在强连锁不平衡关系。