《表1 SLAF标签及SNP位点在各染色体上的数量统计》

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《基于SLAF-seq技术的葡萄种质遗传多样性分析》

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对304份葡萄样品进行测序，共得到663.59 M clean reads。通过序列分析，从304份葡萄材料中共开发466 618个SLAF标签，其中多态性SLAF标签有392 374个，每个样品的平均测序深度为8.09×。通过对多态性SLAF标签进行分析，共获得4 241 729个群体SNP标记。根据完整度>0.8，次要等位基因频率（MAF)>0.05过滤，共得到481 192个高一致性的群体SNP。不同染色体上的SLAF标签与SNP标记的分布见表1，葡萄约有4.16亿个碱基，大约每1 kb DNA序列长度上有一个SNP。简化基因组测序正常，可用于后续的遗传关系分析。