《表4 SLAF标签和SLAF marker在各染色体上的分布》

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《SLAF-seq BSA定位水稻黄叶转绿基因grc2的效果研究》


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质量性状基因定位效果与亲本多态性标记数量和分离群体大小有密切关系;下一代重测序技术的诞生和发展,使Super BSA技术摆脱了双亲遗传距离及遗传定位群体大小的限制。在本研究中,尽管'grc2'与'Y58S'的多态性只有10%(表3),定位所用的极端分离个体也仅100个,但是最终成功关联上了grc2,这取决于SLAF标签的高覆盖度和良好的均匀性。类似的Super BSA方法对亲本遗传距离、分离群体中的显隐性个体数量要求都不高(如30个左右),且一般只需进行简化测序,大大降低了投入时间和成本(陈竹锋等,2014;Zhang et al.,2018)。综合看来,SLAF-seq BSA技术省时省力,能快速鉴定到目的基因的关联区间,若与传统连锁分析技术结合将可实现质量性状基因高效、精准地定位。