《表4 主效QTL区间内SLAF标记功能预测》

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《[落羽杉×墨西哥落羽杉（墨杉）]×墨杉回交子代扦插生根性状的遗传变异及QTL定位》

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25个在转录组数据库中有比对结果的SLAF序列，其中18个有功能注释（表4）。4个SLAF标签序列（1个位于q3-1，3个位于q4-1）比对上的unigene被注释成Tnt1的同源序列，其中1个SLAF标签（marker 20672）位于q3-1，3个SLAF标签（8383、7163和82602）位于q4-1。20672(q3-1）和8383(q4-1）比对上的是同一条unigene(CL1509.Contig4＿All）。Tnt1属于烟草（Nicotiana tabacum）基因组中Ty1-copia类活性长末端重复序列（long terminal repeat，LTR）反转录转座子[22]。反转录转座子在植物中普遍存在，通常能占到植物基因组的一半以上，在玉米中其比例占基因组DNA的50%～80%[23]。主效QTL区间内出现多个LTR同源序列与反转录转座子在植物基因组中的高拷贝性一致。