《表3 不同鸡种CENPA基因上SNPs及对应氨基酸变化》

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《CENPA基因在不同鸡种上的序列比较分析》

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注:>前的为突变前的碱基或氨基酸，>后的为突变后的碱基或氨基酸

从表2中可以看出，CENPA全长共1 925 bp，位于鸡的16号染色体上，处于56 525—58 449的位置，包含了4个外显子和5个内含子。在25个不同鸡种中CENPA共有31个SNPs位点，4种缺失和6种插入。4个外显子上只有4个SNPs，没有插入缺失。5个内含子中只有3个内含子有SNP和InDel，共有27种SNPs，4种插入和6种缺失。由表3可以看出，在4个外显子上，25个鸡种累计只有8个SNPs。只有7个鸡种在外显子上有SNPs位点，其他鸡种上没有出现。Exon1和Exon4上的突变都属于同义突变，并没有引起氨基酸的改变。Exon2上的突变属于错义突变，突变为C57066T，该突变导致编码蛋白P变成了蛋白L。由此表明CENPA的外显子没有丰富的多态性，CENPA内含子的丰富多态性体主要现在Intron4上。在Exon3上所有的鸡种都没有SNPs位点和InDel位点，表明CENPA基因在Exon3具有保守性，在鸡的进化历史中稳定遗传。