《表4 TAP1基因中外显子11的SNPs和氨基酸变化》

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《不同鸡种TAP1基因SNPs和INDEL比对分析》

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系统发育树或系统进化树是用来概括各物种之间的亲缘关系和物种之间的进化关系。本研究选取的29个鸡种在体型和地理分布存在着一定程度的联系：从体型上看，茶花鸡、藏鸡，体型较小，而文昌鸡体型中等紧凑，可能与基于肉用目的进行长期选择有关；而斗鸡、大骨鸡、斗鸡杂交等的体型都比较大；从地理分布来看，3个类群的鸡种分布相对集中，第一类群（仙居鸡、萧山鸡、固始鸡等）主要分布于我国东南区，而茶花鸡、藏鸡分别分布在相邻的云南和西藏地区，陈国宏[20]、刘博等[21]利用微卫星技术和血液蛋白质多态性分析我国地方鸡种的亲缘关系发现，茶花鸡与藏鸡聚为一类，说明它们亲缘关系较近，与研究结果一致，也从侧面证明了聚类的合理性。