《表3 SNP组合联合鉴定模拟分析比较》

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《基于全基因组SNP高效鉴定水稻种质资源并构建指纹图谱》


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注:a:Core=core SNPs;b:hPIC=high PIC SNPs(PIC>0.45);c:r SNP=random SNPs

将134套13个SNP的标记组合和1套12个SNP的标记组合构成并集对品种进行联合鉴定,并集含39个核心SNP标记(表2)。为检测并集组合是否能够提高鉴定准确率,分五个实验组进行联合鉴定模拟分析,5个实验组使用的SNP标记分别为:39个核心SNP标记(Core39)、26个随机核心SNP标记加上13个高PIC值(PIC>0.45)的随机SNP标记(Core26+hPIC13)、13个随机核心SNP标记加上26个高PIC值随机SNP标记(Core13+hPIC26)、39个高PIC值随机SNP标记(hPIC39)、39个随机SNP标记(rSNP39)。每个实验组进行3轮模拟分析(表3)。