《表7 序列比对结果:黄瓜杂交种品种鉴定SNP标记的初步分析研究》

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《黄瓜杂交种品种鉴定SNP标记的初步分析研究》


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注:(1)可比对读长:比对到参考基因组上的总reads(单端与双端)数目;(2)正确比对读长:比对到参考基因组且方向正确的读长。

测序共产生约47.28 Gb原始数据(每样品平均约4.3 Mb原始数据),JY315读长数据最少。最终获得有效数据(表6),其中参试品种60%以上的读长均可正确比对到参考基因组(黄瓜L9930参考基因组大小约367 Mb[6])接近196 Mb序列(表7)。