《表2 鉴定57个油橄榄品种所需最少的SNP位点组合》

《表2 鉴定57个油橄榄品种所需最少的SNP位点组合》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《油橄榄(Olea europaea L.)核心SNP位点筛选与评价》


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以本研究采用的57个油橄榄品种为材料,我们采用核心SNP位点进行品种间的鉴定,探讨对全部57个品种实现鉴定、区分所需的最少SNP位点数。利用SNP/INDEL工具,将14 125个SNP位点按照位点数目4~15个依次开展分层筛选,统计不同位点数目组合对品种的识别度。当SNP位点组合数为4时,对品种的区分度不足15%,随着组合位点数的增多,对油橄榄品种的识别度也逐步提高(图4)。当组合位点数上升到11时(表2),其识别度高达100%,即实现对全部57个品种的区分鉴别至少需要11个核心SNP位点。