《表4 对区间内部分SNP位点进行鉴定》

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《基于BSA-Seq技术挖掘大豆中黄622的多小叶基因》

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混池read值中，逗号前为SNP位点参考碱基的read值，逗号后为突变碱基的read值。

根据原始测序数据，区间内的SNP有43个，其中高质量的SNP有6个，低质量的SNP有37个。为了验证过滤SNP方法的可靠性，进一步筛选候选基因，本试验设计了3对引物（表3），分别用以鉴定1个高质量的SNP及其2侧的低质量SNP位点。其中引物SNP2的扩增产物片段全长7016 bp，包含1个高质量的SNP位点，而引物SNP1扩增产物片段全长5633 bp，包含该高质量SNP上游的5个低质量位点，引物SNP3扩增产物片段全长1247 bp，包含该高质量SNP下游的3个低质量位点。对两亲本PCR产物进行测序鉴定。两亲本序列比对结果表明，中品661和中黄622在8个低质量的SNP位点处均无变异，而2个亲本在高质量SNP处的测序结果与重测序结果一致（表4）。这些结果为候选基因的筛选提供了参考依据。